FFPEからのmRNA, miRNA

サービスの概要

本受託解析サービスはFFPE（ホルマリン固定パラフィン包埋）サンプルのRNAを測定対象とした3D-Gene® mRNA Oligo chip、もしくは3D-Gene® miRNA Oligo chipを使用した解析に関するものです。

FFPEサンプルからの遺伝子発現解析

FFPEサンプルは世界中に多く保管され、それらを遺伝子発現解析に有効活用することが期待されていますが、FFPEサンプル抽出されるRNAは一般に品質が低下しており、遺伝子発現解析による定量的な評価は難しいと考えられています。東レは、高感度DNAチップ"3D-Gene"の特長である検出感度の高さを活かし、FFPEサンプルからでも網羅的遺伝子発現解析を定量的に実施できる技術を開発しています。
詳細について資料をご提供いておりますので、ご希望の方はPDFをダウンロード願います。

こちら資料のダウンロード

ご準備いただくサンプル

	薄切片	パラフィンブロック
サンプル量	10μm厚を5枚以上（組織サイズが5mm角以下の場合は10枚以上）	別途お問い合わせ下さい

※ホルマリン固定、パラホルムアルデヒド固定に限ります。その他の場合は、別途ご相談下さい。

注意事項

• 薄切片は薄切直後のものを冷凍便（ドライアイス同梱）にてご送付ください。なお輸送時のトラブルに関し、弊社はその責任を負いかねます。
• RNAの品質を低下させないために、可能な限りミクロトームのブレードをRNaseフリーの状態にして薄切してください。
• 感染性の高いサンプルはお受けできない場合がございます。ご了承ください。
• ご依頼いただくサンプルがヒト由来の場合は、必ずインフォームドコンセントを得てください。また、個人情報保護の観点から、氏名、イニシャル等ではなく、記号などでの匿名化をお願いします。
• お預かりできるサンプルは、文部科学省が「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」にて定めるP1レベルのものに限らせていただきます。
• サンプル（薄切片および抽出、増幅したRNA）は原則としてご返却いたしかねますので、ご了承ください。
• マウス組織や生検サンプル等、組織サイズが小さいFFPEサンプルをご依頼の場合、1枚あたりのRNA抽出量が非常に少なく、RNAの品質確認ならびに解析が困難となる可能性があります。ご了承ください。
• FFPEの作製、保管条件によっては、十分量のRNAが抽出できず、品質確認が困難となることがございます。ご了承下さい。
• 抽出されたRNAの品質が解析するのに十分でないと考えられる場合は、以降の解析を実施するか否か、ご相談させていただきます。
• 本受託解析は試験研究以外の目的（例えば、医療診断や医療用品・食品の製造・検査）には使用しないで下さい。
• 本解析は当社のプロトコールに従って得られた解析結果をそのまま納品するものであり、解析結果の有用性、目的適合性等を保証するものではありません。

サンプル送付方法

• FFPEの薄切片は、10μm厚で作製し、スライドガラスに貼り付けずに、サンプルチューブに入れてしっかりと蓋をし、チューブにサンプル名を明記してチャック付き袋に入れた状態で、冷凍便（ドライアイス同梱）にて、お送りください。
• サンプルチューブは直接ドライアイスに触れないよう、箱、チャック袋、エアクッションなどで保護して下さい。
• 予めご相談した日時指定で下記までご送付ください。
• サンプルがヒト検体由来の場合、サンプルには個人情報を記載しないでください。サンプル名には氏名、イニシャル等ではなく、記号などでの匿名化をお願いいたします。
• 到着時に状態を確認します。弊社基準を満たさない場合、あらためてサンプルを送付いただくことがございます。

サンプル送付先

レポート、解析オプション

レポートとして、下記資料を納品します。

• 解析報告書
• Rawデータ
• 解析マニュアル

※ 電子ファイルはCD-RまたはDVD-Rに保存し、納品します。

解析オプションでは、DNAチップから得られた数値化データを、群分け解析や群比較解析などの統計学的な解析をいたします。

クラスター解析